Σαν σήμερα, στις 25 Ιουνίου 1992, ανακοινώθηκε η πρώτη μεταγραφή της εποχής Μελισσανίδη – Καρρά στην ΠΑΕ ΑΕΚ.

Λίγες μέρες νωρίτερα, το νέο ιδιοκτησιακό δίδυμο είχε αποκτήσει το πλειοψηφικό πακέτο των μετοχών από τον Ανδρέα Ζαφειρόπουλο. Η επιλογή τους για το ξεκίνημα ήταν ο 23χρονος τερματοφύλακας Ηλίας Ατματσίδης, ο οποίος τότε αγωνιζόταν στους Πόντιους Βέροιας.

Ο Ατματσίδης ήταν μέλος της ομάδας των Ποντίων που πανηγύρισε την ιστορική άνοδο στη Β’ Εθνική εκείνη τη χρονιά. Ο νεαρός τότε γκολκίπερ ξεχώριζε ήδη για το ψυχωμένο στυλ, τα αντανακλαστικά και την αρχηγική του παρουσία κάτω από τα δοκάρια, κάτι που του χάρισε και το προσωνύμιο «Τανάλιας».

Την πρώτη του σεζόν στην Ένωση (1992-93), ο Ατματσίδης είχε περιορισμένες συμμετοχές, καθώς μπροστά του υπήρχαν οι Αντώνης Μήνου και Σπύρος Οικονομόπουλος – ο οποίος προτιμήθηκε από τον Κοφινά που αποχώρησε. Ωστόσο, τη δεύτερη χρονιά πήρε φανέλα βασικού και από τότε δεν την ξαναέβγαλε.

Ο Ατματσίδης έγινε βασικό και αναντικατάστατο στέλεχος της ΑΕΚ, κατακτώντας με την ομάδα: 2 πρωταθλήματα, 4 Κύπελλα Ελλάδας, 1 Super Cup.

Συνολικά σημείωσε 373 συμμετοχές και ένα γκολ με τη φανέλα της ΑΕΚ. Το 2003 μετακόμισε στον ΠΑΟΚ, όπου και ολοκλήρωσε την καριέρα του.

Ο Ηλίας Ατματσίδης είχε 47 συμμετοχές με την Εθνική Ελλάδας και ήταν μέλος της ομάδας που συμμετείχε στο Μουντιάλ του 1994 στις ΗΠΑ. Το 1998 και το 1999 ψηφίστηκε καλύτερος τερματοφύλακας του ελληνικού πρωταθλήματος, επιβεβαιώνοντας την κλάση και τη συνέπειά του στο υψηλότερο επίπεδο.